Programmation et modèles

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Cours magistraux
- Descriptif détaillé des principaux éléments du cours
Partie I : Modélisation
? Notion de modèle
? Représentation simplifiée d'un système
? Modèles en science expérimentale
? Pourquoi modéliser : comprendre, prévoir, apporter des connaissances
? Démarche de modélisation
? Choix des outils et conséquence sur l'analyse et l'interprétation des processus
? Modèles analytiques : exemples pris sur les modèles classiques (logistique, Lotka Volterra, compartiments, Leslie...)
? Modèles de simulation informatique : analyse numérique (?), modèles individus centrés.
Partie II : introduction à la programmation orienté objet
? Notions d'algorithme et de programmes
? Algorithmie : variables / opérateurs / expression, structures de contr?le, structures de données
Travaux Dirigés
- Descriptif détaillé des principaux éléments des TD
? Analyser de différents modèles : chronique, plan de phase,
? Modification des processus modélisés et analyse du nouveau système. Illustration sur des problématiques de conservation biologique.
? Exercices d'algorithmie
Travaux pratiques
? Prise en main d'un environnement LINUX
? Implémentation des algorithmes vus en TD, programmation en langage python
? Projet de développement informatique : conception d'un modèle de simulation d'un système biologique (de type dynamique de population)

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