Nature UE
Crédits ECTS 6
Volume horaire total 51
Volume horaire CM 12
Volume horaire TP 39

Pré-requis

Aucun pré-requis.

Objectifs

? Connaitre les principaux serveurs dédiés à l’analyse des génomes ? Apprendre à utiliser des bases de données pour intégrer des données massives et hétérogènes ? Initiation au travail d’équipe ? Comprendre le principe et savoir utiliser des outils bio-informatiques dédiés à l’analyse de séquences ? Apprendre à construire une chaine de traitement efficace ? Utiliser une sélection de langages de programmation utilisés en bioinformatique (Python, Bash)

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COURS MAGISTRAUX ( 12 H)

Initiation à l'algorithmie à travers les points suivants :
? Constantes et variables
? Instructions élémentaires
? Expressions et opérateurs
? Structures de contr?le
? Fonctions et procédures
? Tableaux et tableaux associatifs
? Pointeurs
? Gestion des fichiers
Introduction au langage de programmation Python

TRAVAUX PRATIQUES ( 39 H)

? Pratique du langage de programmation Python (32 h de TP)
? variables, structures de contr?les, …
? développement et test de programmes
? Projet Individuel (6h de suivi)
? le même projet sera réalisé par chaque étudiant
? Le projet est à rendre sous la forme d'un programme Python bien commenté

Appartient à

Informations complémentaires

? Connaitre les principaux serveurs dédiés à l’analyse des génomes ? Apprendre à utiliser des bases de données pour intégrer des données massives et hétérogènes ? Initiation au travail d’équipe ? Comprendre le principe et savoir utiliser des outils bio-informatiques dédiés à l’analyse de séquences ? Apprendre à construire une chaine de traitement efficace ? Utiliser une sélection de langages de programmation utilisés en bioinformatique (Python, Bash)